सैफ अमृता से प्रभावित हुए और फिर उन्हें डिनर के लिए पूछा. एक इंटरव्यू में सैफ ने अमृता के साथ अपने रिश्तों पर खुलकर बात की थी. उन्होंने बताया था कि पहली डेट पर उन्होंने अमृता के साथ बहुत अच्छा वक्त बिताया था, उन्हें अमृता को करीब से जानने का मौका मिला था. इसके बाद धीरे-धीरे और करीबियां बढ़ीं और दोनों ने 1991 में शादी कर ली.
इसके बाद दोनों दो बच्चों (सारा और इब्राहिम) के माता-पिता बने लेकिन 13 साल में दोनों की राहें जुदा हो गईं. 2004 में इनक तलाक हो गया. सैफ ने एक इंटरव्यू में खुलासा किया था कि तलाक के बाद एलिमनी के तौर पर उन्हें अमृता को 5 करोड़ रुपए देने पड़े.
इसमें से 2.5 करोड़ रुपए पहली बार में ही देने पड़े थे और उसके बाद बेटे इब्राहिम के 18 साल के होने तक 1 लाख रुपए महीना देने का फैसला हुआ था. इसके बाद 2.5 करोड़ उन्होंने बाद में चुकाए थे. सैफ ने ये भी कहा था कि उन्हें अमृता से कोई शिकायत नहीं है, वो उनकी ज़िंदगी का अहम् हिस्सा रही हैं. वह उन्हें और बच्चों को केवल खुश देखना चाहते हैं. अमृता से तलाक के बाद सैफ ने 2012 में करीना कपूर से शादी की थी जिसके बाद 2016 में वह तैमूर के पिता बने.