खाली पेट ग्रीन टी पीना ठीक नहीं, पेट में एसिड की मात्रा बड़ सकती है. इससे कब्ज, एसिड रिफ्लक्स और नॉजिया सहित पाचन संबंधी समस्याएं हो सकती हैं. अल्सर से पीड़ित लोगो को ग्रीन टी से बचना चाहिए. ग्रीन टी का अधिक मात्रा में सेवन करना डायरिया का भी कारण बन सकता है. इसमें मौजूद कैफीन कुछ लोगो में सिरदर्द भी कर सकता है. ग्रीन टी पीने से शरीर में आयरन की कमी आती हैं. एनीमिया के पीड़ित लोगों को इसका सेवन नही करना चाहिए. कैफीन लीवर पर भी दबाव डाल सकता है. डॉक्टर रोजाना केवल दो कप ग्रीन टी पीने की सलाह देते है. ज्यादा कैफिन गर्भावस्था में जोखिम बड़ा सकता है.